哈哈，这个问题有意思了，为什么佐助开的是单轮回眼呢?个人认为最重要的原因是岸本为了平衡各角色之间的的实力，因为轮回写轮眼的能力过于逆天，博人的净眼也是如此。下面具体说明一下。
首先岸本在火影早期就有为了平衡角色实力进行的各种设定，最明显的例子就是带土两只写轮眼的能力被强行分开。一只写轮眼给了卡卡西，另外一只带土自己留着用。而双神威的能力大家在火影后期已经基本都了解了，如此厉害的能力为了剧情发展肯定是要限制的。更不用说比一般轮回眼能力逆天的轮回写轮眼了，不知道各位注意到没有火影中有勾玉的轮回眼都是单只存在的，辉夜的也只有一只轮回写轮眼（斑也一样）。因此个人认为佐助为何只有一只轮回写轮眼也就清楚了，因为后期为了尽快结局鸣人和佐助之间的综合实力不能差异太大，需要维持平衡。否则最后如果佐助有两只轮回写轮眼力量平衡就打破了，鸣人都制衡不了佐助。同理辉夜拥有一只轮回写轮眼能够使用天之御中，黄泉比良坂和无限月读这些能力那么有两只的话鸣人和佐助根本打不过辉夜了，所以个人认为由于轮回写轮眼能力过于逆天所以有限制。
为了限制轮回写轮眼过于强大的能力只能是单只出现
其次博人传中漩涡博人的净眼个人认为也是这种情况，我们知道白眼之上是转生眼，那么转生眼之上是什么眼?个人推测有可能就是博人拥有的净眼了，能力过于逆天因此只有一只。毕竟博人传还有很长的连载时间，主角也需要一个磨砺成长的过程。如果作者一开始给博人有两只净眼，那么相当于游戏里边满级的大号打小怪了。吸引不了观众的眼球，不利于剧情的展开和发展。所以作者对于净眼的设定也是目前只有一只，既让主角开挂又不让主角能力过于逆天。
最后总结一下，个人认为由于佐助为何只有一只轮回写轮眼官方并没有明确的说法因此只能推测岸本是为了角色实力对比不至于差距过大做得设定，博人的情况也是如此。分析不到位地方请见谅，各位有其他想法欢迎留言讨论。
佐助开启的是单轮回眼有两个原因，一个是六道仙人故意给他取走了一只轮回眼，还有一个是六道仙人只让他开了一只轮回眼。
佐助是木叶村的无冕之王，终结谷一战后以一条手臂的单价终于放弃了仇恨。忍界大战之后纲手为了忍界有更强的力量对抗外来入侵者，利用柱间的细胞给鸣人和佐助各培育了一条手臂，只是不知道为何鸣人可以欣然接受，而佐助一直都不敢面对呢？或许他移植了柱间细胞培育的手臂就有机会开启双轮回眼。
佐助这个轮回眼是因柱间的力量而开还是六道仙人直接给予的动漫中并没有说明。不过小编觉的佐助在见六道仙人之前就已经具备了开启轮回眼的条件（先是柱间给了佐助一部分力量，后是宇智波斑给了佐助一剑让他处于了濒临死亡，在然后是兜将佐助救起，面对了死而复生），之所以开启了一只，很有可能是六道仙人只让他开启了一只，不然又何谈将自己的力量平均的分配给两人呢？要知道想当年阿修罗是在众人的帮助下才战胜的因陀罗哦。
其实佐助之所以开启的是一只轮回眼还有一个可能，那就是之前的铺垫都无效，佐助在见到六道仙人的那一刻仙人就知道了辉夜即将复生，他为了能让佐助和鸣人对抗辉夜特将自己的一部分力量给了佐助，而这部分力量正是轮回眼。
为啥是一只捏
那我就来分析分析，博人是鸣人和雏田的孩子，那就相当是大筒木羽衣和大筒木羽村的后代（还好过了这么多代），要是隔的太近的近亲，说不定博人是个傻子（也有可能是爱因斯坦一样的天才）。
在我看来博人的净眼是一种反祖现象
，得到纯净的大筒木一族的力量，为啥是是独眼，那就是血脉的力量不够，只开启得了一半，成了独眼。说不定净眼就是大筒木一族白眼的进阶，就如写轮眼进阶为万花筒写轮眼，净眼应该是大筒木血脉纯净的表现，博人传漫画大筒木桃式不是说过“继承大筒木力量的净眼少年”说明净眼在大筒木一族也是有地位的，就如宇智波一族的万花筒写轮眼的族人
再说佐助，佐助和鸣人在后期实力已经跟不上大BOSS斑还有辉夜了，于是他们频死前见到六道仙人灵魂，给他们开挂了，但是这个挂是2人分的啊，佐助就得到了阴遁力量，挂就拿到一半，眼睛肯定就给你个独眼咯，就像买东西，一分钱一分货，你1000块还想买苹果8吗，有个独眼就算有良心啦！毕竟级别上去了
以上冲聪的二次元
很简单，火影大结局时六道仙人分别给了鸣人和佐助阴阳遁之力，左阴右阳，阳之体阴之瞳。值得注意的是，佐助的轮回眼相别于斑的轮回眼，是带勾玉的。至于为什么，问岸本才知道。
这个简单主要作者想他开单眼就是单眼，想双眼就是双眼，只要岸本喜欢就好了
个人意见:
首先是拿两个开轮回眼的原理例子来对比。
首先是宇智波斑，斑开眼的原理是如下公式:“阿修罗查克拉＋因陀罗查克拉＝六道仙人的查克拉＝轮回眼”。
由此得到轮回眼开眼的关键——六道仙人的查克拉。轮回眼和六道仙人查克拉的关系:漫画辉夜是得到人们祈福自孕，生下六道仙人，六道仙人天生轮回眼，而后又生下阿修罗和因陀罗，六道仙人的查克拉因此分流了，只要融合这两股查克拉就能得到六道仙人查克拉，开轮回眼。
而斑就是通过融合查克拉方法开启轮回眼。
再看佐助开启的方法，佐助是直接得到六道仙人本人给的查克拉开启，而不是通过融合。六道仙人的查克拉不是简单的查克拉，他包含了辉夜的查克拉（六道从辉夜那继承大量的查克拉）、六道自己的查克拉，因为辉夜的查克拉佐助开启了独一无二的六勾玉轮回眼，而斑通过融合只得到单纯的六道仙人查克拉，所以是普通轮回眼。
至于六道仙人自己有辉夜查克拉怎么没有六勾玉轮回眼，个人认为是六道仙人天生（出生）就轮回眼了，而火影又没有轮回眼升级的设定，所以一直是普通轮回眼。
因为他开的是勾玉轮回眼，勾玉轮回眼就是单只存在的，只不过他们的长在额头上。轮回眼是宇智波得到柱间细胞开的，和佐助这个不一样，是六道给的。而且明显看到开轮回眼会导致原来万花筒功能的消失，也就是，轮回眼会挤占原写轮眼的位置，但是不会挤占轮回眼的位置，所以辉夜和斑的勾玉在额头，二柱子的在左眼，如果二柱子见六道之前开了轮回眼，没准这个勾玉轮回眼也放在额头了。再一个就是二柱子毕竟颜值担当，不管是双轮回还是额头开眼，都不如原来的万花筒好看，所以给他留了一只，拉下颜值~_~
因为六道把力量平分了，佐助获得阴之力，鸣人获得阳之力。而当初的班是阴阳之力统一的，或者说当初六道没有平分力量，都给了阿修罗，轮墓就是阴阳之术。所以一半力量开一只轮回眼也没什么说不过去的
因为他那只眼睛是鼬的，在我的认知里面，佐助是最爱他哥哥的，最后佐助知道了鼬的难处，可能是留了个念想吧，不要骂我哈，这是我的理解，大家怎么想的可以和我一起讨论哦
有没有认真看火影？六道仙人把自己的六道之力一分为二给了鸣人和佐助一人一半。只有得到全部的六道之力才能开启双眼。所以佐助才开了一只轮回眼，为的是平衡他们二人之间的实力不会出现过大的差距，造成像当初因陀罗和阿修罗的那种情况。让他们各自去寻找自己心中的答案。有问题的话可以去看最后的那几集。
岸本给佐助两只轮回眼佐助就已经统一五村了吧。
你们都没有看火影吗？
佐助的其中一只眼睛，由带土安装成鼬的永恒万花筒写轮眼了！
他只得到一半力量
眼睛是六道仙人给的[抠鼻][抠鼻]
1、双轮回画面重复，岸本想给主角画特别的眼睛有特别的能力；
2、双轮回挂太牛逼，与第一主角鸣人实力会不对等；
3、佐助的属性是阴属性，拥有因陀罗查克拉转世是阴属性，六道仙人给的一半力量属性仍是阴属性，叠加起来就成为单六勾玉轮回眼且瞳力极强。
原因很简单，六道仙人是忍宗的开山鼻祖，他自身拥有着强大的查克拉，而查克拉分为身体能量与精神能量，这身体能量就是生命力的表现，精神能量就是操控精神的状态，这时六道的俩儿子体内的能量就开始分化了，一个是继承了六道仙人阴之力的因陀罗，因生来就具有强大的查克拉和万花筒写轮眼而被称为天才，另一个就是继承了六道仙人阳之力的阿修罗，虽天生生命力强大但缺少阴属性查克拉的补全而被认为天赋不好。
在六道仙人这俩儿子的传宗接代下分化出了无数的家族，但在历史的长河中，因陀罗的后人与阿修罗的后人一直都有矛盾，直到现在的宇智波家族的佐助和漩涡家族的鸣人到来，两个家族的矛盾与羁绊也在不断的演变。
最终的忍者大战里，召唤出六道仙人后，他也有解释两大家族的渊源，在打开两人的心结与千年的羁绊后，为拯救忍界把自己的力量分为两份，为阴之力和阳之力，把适应阴之力的因陀罗后人佐助的阴属性打开并强化，但他始终缺少阳之力的仙人体调和，最终只打开了一只眼睛，而鸣人在接受阳之力打开了仙人体后获得了六道仙人的体质，他最缺少的阴属性查克拉则由九大尾兽和仙术补充，最后在阴之力与阳之力完美相融后所使出的六道仙人最强封印忍术才是真地爆天星。
与常识一样，有多大能耐办多大事，只继承仙人一半的力量当然只拥有仙人一半的能力咯。
我都说了好几遍了，佐助是主角，帅就完了，二助子是b王，一贯风格，必须得个性。
班爷能自由切换写轮眼，万花筒写轮眼，永恒万花筒写轮眼，轮回眼，为啥佐助就不行呢？